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羊源性成分探针法荧光定量PCR试剂盒通用原则

点击次数:651 更新时间:2022-03-17
 

羊源性成分探针法荧光定量PCR试剂盒通用原则:


1, 先选择好探针,然后设计引物使其尽可能的靠近于探针。


2, 扩增子的长度应不超过400bp,理想的*能在100-150bp内,扩增片断约短,有效的扩增反应就越容易获得。较短的扩增片断也容易保证分析的一致性


3, 保持GC含量在20%和80%之间,GC富含区容易产生非特异反应,从而会导致扩增效率的降低,及在SG分析中非特异信号。


4, 为了保证效率和重复性,应避免重复的核苷酸序列,尤其是G(不能有4个连续的G)


5, 将引物和探针互相进行配对检测,以避免二聚体和发卡结构的形成。


b),探针设计指导


1,在设计引物之前设计探针


2,探针的Tm值应在68-70℃之间,如果是目测探针,则要仔细审查GC富含区。


3,探针的5’端要避免有鸟an酸,5’G会有淬灭作用,即使被切割下来这种淬灭作用也还会存在


4,选择C多于G的链作探针,G的含量多于C会降低反应效率,这时就应选择配对的另一条链作为探针。


6, 探针应尽可能的短,不要超过30个bp。


7, 检测探针的DNA折叠和二级结构。

小鼠神经干细胞(EGFP标记)

人脑微血管内皮细胞

人脑血管平滑肌细胞

人海马神经元

人少突胶质细胞

人星形胶质细胞

小鼠成纤维细胞(EGFP标记)

mCF, 小鼠心脏成纤维细胞

MN-c, 小鼠皮质神经元

MN-h, 小鼠海马神经元

MSC, 小鼠雪旺细胞

MA, 小鼠星形胶质细胞

MLF, 小鼠淋巴成纤维细胞

mRTEC, 小鼠肾小管上皮细胞

CSC, 小鼠心肌细胞

mEPC, 小鼠内皮祖细胞-骨髓

MEF, 小鼠胚胎成纤维细胞

NSC,大鼠神经干细胞

RN-h, 大鼠海马趾神经元

rEPC,大鼠内皮祖细胞-骨髓

RN-c, 大鼠皮质神经元

RN-s, 大鼠纹状体神经元

RSC, 大鼠雪旺细胞

RA, 大鼠星形胶质细胞

RLF, 大鼠淋巴成纤维细胞

rRTEC, 大鼠肾小管上皮细胞

rCSC, 大鼠心肌细胞

RDFs, 大鼠真皮成纤维细胞

RLFs, 大鼠肺成纤维细胞

rCF, 大鼠心脏成纤维细胞

MN-h, 小鼠海马神经元

MN-s, 小鼠纹状体神经元

mOPC, 小鼠少突胶质前体细胞

MA, 小鼠星形胶质细胞

MLF, 小鼠淋巴成纤维细胞

mRTEC, 小鼠肾小管上皮细胞

CSC, 小鼠心肌细胞

小鼠骨髓间充质干细胞(BMSCs)

MEF, 小鼠胚胎成纤维细胞


 
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