Spindlin1与组蛋白H3K4me3识别的机理
2012年10月17日，美国*院刊（Proceedings of the National Academy of Sciences）在线发表了生物大分子国家重点实验室许瑞明、饶子和课题组和NIBS朱冰课题组合作的研究成果，该文章题为Distinct mode of methylated lysine-4 of histone H3 recognition by tandem tudor-like domains of Spindlin1。
组蛋白甲基化是表观遗传学的核心内容之一，其中关于甲基化的识别是近年来研究的热点。甲基化识别蛋白是表观遗传信号的执行者，它们特异地识别不同位点、不同形式的甲基化修饰，把信号传递给下游与其相互作用的分子，行使表观遗传的生物学功能。许瑞明课题组基于前期基础研究（Genes & Dev. 2003; Science 2006; Genes & Dev. 2009），此次在人源Spindlin1蛋白识别组蛋白H3第4位赖氨酸的*基化修饰（H3K4me3）研究中又取得了进一步成果。
人源Spindlin1蛋白zui早作为纺锤体结合蛋白被发现（Dev. 1997.）。2007年，饶子和课题组解析了Spindlin1蛋白的三维晶体结构（JBC 2007）。2011年NIBS朱冰课题组发现Spindlin1定位在核内活性rDNA重复区，可识别组蛋白H3K4甲基化修饰，进而促进rDNA基因的表达（EMBO Reports 2011）。基于之前的研究结果，许瑞明课题组与朱冰研究员和饶子和教授开展了Spindlin1与组蛋白H3K4me3识别的结构机理研究。结果表明，Spindlin1包含三个串联重复的Tudor结构域，其中只有Tudor II可以结合一个H3K4me3肽段，通过结构分析比较及体内外功能实验检测，研究人员们发现了Spindlin1蛋白识别H3K4me3的*机制：首先，可结合甲基化赖氨酸残基的疏水口袋由4个芳香族残基组成，比其他已知的Tudor结构域识别口袋都多了1个残基，这样的包围的更加紧密，同时对周围的环境要求也更加苛刻；其次，除了构成疏水口袋的芳香族残基，Spindlin1的极性天冬氨酸残基也与H3蛋白N端的精氨酸残基有多处较强的相互作用，分别对D184和D189残基进行突变，不同程度的影响了Spindlin1与H3K4me3肽段的结合能力，下调了体内rRNA基因的转录水平，这些极性相互作用确保了K4位点识别的特异性。
