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PCR反应所需细菌DNA 模板的制备

点击次数:1272 更新时间:2012-08-28
 

PCR反应所需细菌DNA 模板的制备

从分析的标本中纯化核酸,即制备PCR反应的模板,是使PCR获得成功的重要的*步。由于PCR的用途各异,用于抽提核酸的起始材料种类可能差异很大(包括新鲜的、储存的和古代的)。每种特殊样品类型有各自的限制和抽提核酸的不同要求,但它们都有一个共同的标准,扩增的灵敏性要求特别注意不同材料、PCR产物、质粒或对照之间可能存在的交叉污染。由于PCR不需要高分子量和高度纯化的核酸,为zui大限度材料污染的机会,可以使用快速而且简便的提取方法。

【试剂与配制】

TE缓冲液(pH8.0)

裂解缓冲液:2%SDS,10μg/ml蛋白酶K溶于TE中。

RNase A (10mg/ml)

平衡酚

:(24:1)

无水乙醇

70% 乙醇

3mol/L 乙酸钠(pH5.2)

【操作方法】

1、方法一

(1)从平板上挑取至少1.5mm的菌落到一微量离心管中,加入400μl裂解缓冲液,混匀;

(2)55℃~60℃,水浴15~20min;

(3)加入等体积的酚::(25:24:1),混匀;

(4)5000g离心10min;

(5)吸取上层水相,再加入等体积的:(24:1);

(6)重复(3)~(4);

(7)吸取上层水相,加1/10体积3mol乙酸钠及RNase A(终浓度为0.25~0.3μg/μl),轻摇,37℃保温30 min;

(8)加入2.5倍体积的预冷无水乙醇,-20℃ 2hr;

(9)10,000g 离心15min,弃上清,或用无菌细玻棒搅缠出DNA;

(10)70% 乙醇洗2次,待乙醇蒸干后重新溶于小体积去离子水或TE缓冲液中(约20μl)。一次取5~10μl进行PCR反应。

2、方法二

(1) 取一定数量的细菌加入500μlTE缓冲液中;

(2) 100℃煮沸10min,置冰浴保存;

(3) 10,000rpm,4℃离心10min;

(4) 取适量上清作为PCR 模板。

3、方法三

(1) 制备一定浓度的细菌/去离子水悬液,反复冻融3次;

(2) 10,000rpm,4℃离心10min;

(3) 取适量上清作为PCR 模板。

 
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